Всю свою научную жизнь Юрий Цолакович посвятил Лаборатории ядерных реакций, где прошел путь от молодого инженера – начальника пусконаладочной группы циклотрона У-300 до директора и научного руководителя Лаборатории ядерных реакций имени Г. Н. Флерова, стал создателем современной школы физики тяжелых ионов, автором трех открытий, монографии, 11 изобретений, более 450 научных работ.
Ю. Ц. Оганесяну принадлежат основополагающие работы по синтезу новых элементов на пучках тяжелых ионов. Он автор открытия нового класса ядерных реакций – холодного слияния массивных ядер, широко используемых и в настоящее время в различных лабораториях мира для синтеза новых элементов вплоть до Z = 113.
Для исследований предельно тяжелых ядер Ю. Ц. Оганесяном были предложены реакции слияния нейтронообогащенных изотопов актинидов с ускоренными ионами кальция-48 и создана прецизионная экспериментальная установка с рекордной чувствительностью, регистрирующая образование и распад отдельных атомов. В 1999–2015 гг. в этих реакциях были впервые синтезированы изотопы новых химических элементов с Z=112–118, свойства распада которых являются прямым доказательством существования «островов стабильности» в области сверхтяжелых элементов. Это стало одним из самых ярких открытий в ядерной физике за последние 40 лет.
Приоритет в открытии новых 114–118-го элементов за возглавляемой Ю. Ц. Оганесяном научной коллаборацией (ЛЯР ОИЯИ, Ливерморская и Окриджская национальные лаборатории США) признан Международными союзами IUPAC и IUPAP. 114 элементу присвоено наименование «флеровий» с символом Fl в честь основателя ЛЯР академика Г. Н. Флерова, 115-му – «московий» с символом Mc в честь московского региона. В честь выдающихся научных заслуг и признания основополагающего вклада Ю. Ц. Оганесяна в открытие новых сверхтяжелых элементов 118-й элемент получил наименование «оганесон» – Og.
Большое внимание уделяет Ю. Ц. Оганесян подготовке научных кадров. Он председатель диссертационного совета ЛЯР ОИЯИ. В 2005 году организовал и возглавил кафедру ядерной физики Университета «Дубна». Среди его учеников 11 докторов и более 20 кандидатов наук из числа российских специалистов и других стран-участниц ОИЯИ.