Лаборатория отсчитывает свою историю с 1953 года, когда у засекреченного объекта, где велось строительство синхрофазотрона, появилось официальное название — Электрофизическая лаборатория АН СССР. В 1956 году ЭФЛАН вошла в состав Объединенного института ядерных исследований, став одной из двух первых его лабораторий.
Сегодня ЛФВЭ ОИЯИ – известный всему миру исследовательский центр для проведения актуальных фундаментальных и прикладных работ по физике элементарных частиц и атомного ядра, который осуществляет широкое международное научное сотрудничество.