Жители Пущино и Протвино были против по нескольким причинам. Дело в том, что им накануне принятия не показали ни одного документа, обосновывающего будущее объединение.
К тому же закон говорил о том, что после такого слияния статусы наукоградов будут утеряны. А это означало бы потерю тех, и без того малых финансовых доплат, в которых так всегда нуждались научные организации в Протвино и в Пущино. Как уточнили в пресс-центре Мособлдумы, Протвино имеет статус наукограда до 2034 года, а Пущино – до 2032 года.
Заверениям некоторых депутатов о том, что вместе с Серпуховом они превратятся в один большой и красивый наукоград, никто не поверил. Зато по Сети гулял проект, якобы предоставленный зампредседателя правительства Московской области Марией Нагорной в администрацию президента страны, который «обещал» жителям наукоградов развертывание крупного строительства по проекту "Сила" на их особо охраняемых природных территориях.
Люди, которые опасались за судьбу своих городов, за будущее своих детей, требовали честности и прозрачности, неоднократно выходили на одиночные пикеты. Они требовали законного референдума, но им отказали. Публичные слушания были проведены, но со множеством нарушений.После этого вопиющего беззакония жители стали писать заявления в прокуратуру, в следственный комитет, написали и отвезли несколько писем президенту РАН Геннадию Красникову, в приемную президента Владимира Путина. Но всё было бесполезно - "вопрос был уже решён" и голосование в Мособлдуме носило формальный характер.
