Сегодня в составе Дубненской горбольницы стационар на 394 койки, две поликлиники для взрослых, две – для детей, один филиал детской поликлиники и женская консультация; амбулаторно-поликлиническая служба с центрами здоровья для детей и взрослых, дневным стационаром; отделение лучевой диагностики; клинико-диагностическое отделение (включая ПЦР-лабораторию и баклабораторию); эндоскопическое отделение; патологоанатомическое отделение; аптека.
В 1994 году открыто одно из первых в Московской области отделений гемодиализа; два года спустя – акушерское отделение боксированного типа, первое такого типа в Подмосковье. Уже в 2000 году рабочие места медперсонала были оснащены компьютерной техникой.
В 2006 году все подразделения, оказывающие помощь матерям и детям, получили звание ВОЗ и ЮНИСЕФ «Больница, доброжелательная к ребенку». В 2008 году построена поликлиника на Большой Волге; реконструирована и достроена поликлиника в Левобережье.
В 2015 году открыты два новых отделения: реанимации и интенсивной терапии для новорожденных и недоношенных детей, а также отделение патологии новорожденных. В 2020 году введен в эксплуатацию хирургический центр, в котором функционируют отделения: урологии, оперативной онкологии, травматологии и ортопедии, гинекологии, общей хирургии, абдоминальной хирургии. В марте 2021 года открыто отделение детской хирургии.
Дубненская горбольница имеет лицензии на оказание 32 видов специализированной медицинской помощи на поликлиническом этапе и 28 видов – на стационарном.
В ее коллективе 932 человека. Число врачей за 10 лет выросло с 87 до 216. Квалификационную категорию имеют 48,6% врачей (высшую – 73,4%) и 62% средних медработников. Интересный факт: в больнице работают 18 трудовых династий с общим стажем более 1000 лет!
Ежегодно в поликлиниках врачи принимают около 400 тысяч пациентов. В стационаре получают лечение более 12 тысяч человек. Выполняется более 6000 операций. Принимается около 1500 родов. Выполняется более 40 000 УЗИ-исследований, более 6000 эндоскопических исследований, более 4,5 млн лабораторных исследований.
В разное время больницей руководили такие опытные врачи, как заслуженный работник здравоохранения РФ Л.А. Цыкунова, заслуженный врач РФ В.С. Дмитриев. С 2006 года больницу возглавляет Алексей Валентинович Осипов, заслуженный работник здравоохранения Московской области.