Основой для филиала стали действующее структурное подразделение НИИЯФ МГУ и две кафедры физического факультета МГУ в Дубне. В дальнейшем планируется расширение спектра направлений в сотрудничестве с химическим, биологическим, ВМиК и другими факультетами МГУ.
Филиал МГУ в Дубне создан по инициативе ОИЯИ и будет использовать возможности Института, как уникальной международной организации на территории РФ, по установлению связей и использованию научных результатов и лучших образовательных практик через взаимодействие с зарубежными партнерами, участие в международных проектах в целях подготовки кадров для фундаментальных исследований в государствах-членах ОИЯИ.
Общая численность студентов и аспирантов филиала, обучающихся в Дубне, может составлять от 80 до 160 человек. Директором филиала назначен профессор, член-корреспондент РАН Эдуард Боос, его заместителем — профессор, доктор физико-математических наук Александр Ольшевский.
28 февраля 2022 года Правительство Российской Федерации приняло постановление о внесении изменений в устав Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова, согласно которому в Дубне создан филиал МГУ.
